Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Irx4Q9QY61 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Irx4Q9QY61 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Irx4Q9QY61 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Irx4Q9QY61 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Irx4Q9QY61 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx4Q9QY61 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx4Q9QY61 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx4Q9QY61 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx4Q9QY61 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx4Q9QY61 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx4Q9QY61 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx4Q9QY61 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx4Q9QY61 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx4Q9QY61 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irx4Q9QY61 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Irx4Q9QY61 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irx4Q9QY61 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irx4Q9QY61 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irx4Q9QY61 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irx4Q9QY61 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irx4Q9QY61 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irx4Q9QY61 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irx4Q9QY61 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx4Q9QY61 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx4Q9QY61 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx4Q9QY61 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx4Q9QY61 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx4Q9QY61 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx4Q9QY61 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx4Q9QY61 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx4Q9QY61 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx4Q9QY61 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx4Q9QY61 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx4Q9QY61 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx4Q9QY61 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx4Q9QY61 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx4Q9QY61 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx4Q9QY61 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx4Q9QY61 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx4Q9QY61 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx4Q9QY61 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx4Q9QY61 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx4Q9QY61 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx4Q9QY61 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx4Q9QY61 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx4Q9QY61 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx4Q9QY61 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx4Q9QY61 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx4Q9QY61 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx4Q9QY61 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irx4Q9QY61 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irx4Q9QY61 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Irx4Q9QY61 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irx4Q9QY61 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irx4Q9QY61 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irx4Q9QY61 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irx4Q9QY61 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irx4Q9QY61 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irx4Q9QY61 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irx4Q9QY61 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Irx4Q9QY61 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Irx4Q9QY61 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irx4Q9QY61 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irx4Q9QY61 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irx4Q9QY61 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irx4Q9QY61 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Irx4Q9QY61 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irx4Q9QY61 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irx4Q9QY61 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irx4Q9QY61 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irx4Q9QY61 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irx4Q9QY61 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irx4Q9QY61 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Irx4Q9QY61 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irx4Q9QY61 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irx4Q9QY61 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irx4Q9QY61 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx4Q9QY61 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx4Q9QY61 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx4Q9QY61 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx4Q9QY61 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx4Q9QY61 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx4Q9QY61 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx4Q9QY61 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx4Q9QY61 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx4Q9QY61 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx4Q9QY61 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx4Q9QY61 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx4Q9QY61 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx4Q9QY61 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx4Q9QY61 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx4Q9QY61 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx4Q9QY61 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx4Q9QY61 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx4Q9QY61 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx4Q9QY61 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx4Q9QY61 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx4Q9QY61 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx4Q9QY61 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms