Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dkk3Q9QUN9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Dkk3Q9QUN9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dkk3Q9QUN9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dkk3Q9QUN9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dkk3Q9QUN9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dkk3Q9QUN9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Dkk3Q9QUN9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dkk3Q9QUN9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dkk3Q9QUN9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dkk3Q9QUN9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dkk3Q9QUN9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dkk3Q9QUN9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dkk3Q9QUN9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Dkk3Q9QUN9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Dkk3Q9QUN9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dkk3Q9QUN9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dkk3Q9QUN9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Dkk3Q9QUN9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dkk3Q9QUN9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dkk3Q9QUN9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dkk3Q9QUN9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dkk3Q9QUN9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dkk3Q9QUN9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dkk3Q9QUN9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dkk3Q9QUN9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dkk3Q9QUN9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dkk3Q9QUN9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dkk3Q9QUN9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Dkk3Q9QUN9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dkk3Q9QUN9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dkk3Q9QUN9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dkk3Q9QUN9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Dkk3Q9QUN9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dkk3Q9QUN9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dkk3Q9QUN9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dkk3Q9QUN9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dkk3Q9QUN9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dkk3Q9QUN9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dkk3Q9QUN9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dkk3Q9QUN9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms