Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Csnk1eQ9JMK2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Csnk1eQ9JMK2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Csnk1eQ9JMK2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Csnk1eQ9JMK2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Csnk1eQ9JMK2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Csnk1eQ9JMK2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Csnk1eQ9JMK2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Csnk1eQ9JMK2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Csnk1eQ9JMK2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Csnk1eQ9JMK2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Csnk1eQ9JMK2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Csnk1eQ9JMK2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Csnk1eQ9JMK2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Csnk1eQ9JMK2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Csnk1eQ9JMK2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Csnk1eQ9JMK2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Csnk1eQ9JMK2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Csnk1eQ9JMK2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Csnk1eQ9JMK2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Csnk1eQ9JMK2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Csnk1eQ9JMK2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Csnk1eQ9JMK2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Csnk1eQ9JMK2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Csnk1eQ9JMK2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Csnk1eQ9JMK2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Csnk1eQ9JMK2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Csnk1eQ9JMK2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms