Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB0

Gkap1, G kinase-anchoring protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkap1Q9JMB0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gkap1Q9JMB0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gkap1Q9JMB0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gkap1Q9JMB0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gkap1Q9JMB0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gkap1Q9JMB0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gkap1Q9JMB0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gkap1Q9JMB0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gkap1Q9JMB0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gkap1Q9JMB0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gkap1Q9JMB0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gkap1Q9JMB0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gkap1Q9JMB0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gkap1Q9JMB0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gkap1Q9JMB0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gkap1Q9JMB0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gkap1Q9JMB0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gkap1Q9JMB0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gkap1Q9JMB0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gkap1Q9JMB0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gkap1Q9JMB0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gkap1Q9JMB0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gkap1Q9JMB0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gkap1Q9JMB0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gkap1Q9JMB0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gkap1Q9JMB0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gkap1Q9JMB0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gkap1Q9JMB0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gkap1Q9JMB0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gkap1Q9JMB0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gkap1Q9JMB0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gkap1Q9JMB0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gkap1Q9JMB0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gkap1Q9JMB0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gkap1Q9JMB0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gkap1Q9JMB0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gkap1Q9JMB0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gkap1Q9JMB0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gkap1Q9JMB0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gkap1Q9JMB0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gkap1Q9JMB0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gkap1Q9JMB0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gkap1Q9JMB0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gkap1Q9JMB0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gkap1Q9JMB0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gkap1Q9JMB0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gkap1Q9JMB0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gkap1Q9JMB0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gkap1Q9JMB0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gkap1Q9JMB0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gkap1Q9JMB0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gkap1Q9JMB0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gkap1Q9JMB0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gkap1Q9JMB0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gkap1Q9JMB0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gkap1Q9JMB0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gkap1Q9JMB0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gkap1Q9JMB0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gkap1Q9JMB0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gkap1Q9JMB0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gkap1Q9JMB0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gkap1Q9JMB0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gkap1Q9JMB0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gkap1Q9JMB0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gkap1Q9JMB0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gkap1Q9JMB0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gkap1Q9JMB0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gkap1Q9JMB0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gkap1Q9JMB0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gkap1Q9JMB0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gkap1Q9JMB0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gkap1Q9JMB0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gkap1Q9JMB0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gkap1Q9JMB0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gkap1Q9JMB0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gkap1Q9JMB0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms