Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV6

Pnkp, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkpQ9JLV6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PnkpQ9JLV6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PnkpQ9JLV6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PnkpQ9JLV6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PnkpQ9JLV6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PnkpQ9JLV6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PnkpQ9JLV6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PnkpQ9JLV6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PnkpQ9JLV6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PnkpQ9JLV6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PnkpQ9JLV6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PnkpQ9JLV6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PnkpQ9JLV6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PnkpQ9JLV6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PnkpQ9JLV6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PnkpQ9JLV6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PnkpQ9JLV6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PnkpQ9JLV6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PnkpQ9JLV6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PnkpQ9JLV6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PnkpQ9JLV6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PnkpQ9JLV6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PnkpQ9JLV6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PnkpQ9JLV6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PnkpQ9JLV6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PnkpQ9JLV6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PnkpQ9JLV6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PnkpQ9JLV6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PnkpQ9JLV6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PnkpQ9JLV6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PnkpQ9JLV6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PnkpQ9JLV6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PnkpQ9JLV6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PnkpQ9JLV6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PnkpQ9JLV6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PnkpQ9JLV6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PnkpQ9JLV6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PnkpQ9JLV6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PnkpQ9JLV6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PnkpQ9JLV6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PnkpQ9JLV6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PnkpQ9JLV6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PnkpQ9JLV6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PnkpQ9JLV6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PnkpQ9JLV6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PnkpQ9JLV6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PnkpQ9JLV6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PnkpQ9JLV6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PnkpQ9JLV6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PnkpQ9JLV6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PnkpQ9JLV6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PnkpQ9JLV6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PnkpQ9JLV6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PnkpQ9JLV6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PnkpQ9JLV6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PnkpQ9JLV6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PnkpQ9JLV6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PnkpQ9JLV6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PnkpQ9JLV6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PnkpQ9JLV6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PnkpQ9JLV6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PnkpQ9JLV6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PnkpQ9JLV6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PnkpQ9JLV6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PnkpQ9JLV6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PnkpQ9JLV6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PnkpQ9JLV6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PnkpQ9JLV6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PnkpQ9JLV6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PnkpQ9JLV6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PnkpQ9JLV6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PnkpQ9JLV6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PnkpQ9JLV6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PnkpQ9JLV6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PnkpQ9JLV6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PnkpQ9JLV6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PnkpQ9JLV6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PnkpQ9JLV6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PnkpQ9JLV6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PnkpQ9JLV6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PnkpQ9JLV6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PnkpQ9JLV6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PnkpQ9JLV6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PnkpQ9JLV6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PnkpQ9JLV6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PnkpQ9JLV6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PnkpQ9JLV6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PnkpQ9JLV6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PnkpQ9JLV6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PnkpQ9JLV6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PnkpQ9JLV6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PnkpQ9JLV6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PnkpQ9JLV6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PnkpQ9JLV6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PnkpQ9JLV6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PnkpQ9JLV6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PnkpQ9JLV6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PnkpQ9JLV6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PnkpQ9JLV6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PnkpQ9JLV6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms