Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col5a3Q9JLI2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col5a3Q9JLI2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col5a3Q9JLI2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col5a3Q9JLI2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col5a3Q9JLI2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col5a3Q9JLI2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col5a3Q9JLI2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col5a3Q9JLI2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col5a3Q9JLI2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col5a3Q9JLI2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col5a3Q9JLI2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col5a3Q9JLI2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col5a3Q9JLI2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col5a3Q9JLI2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col5a3Q9JLI2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col5a3Q9JLI2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col5a3Q9JLI2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Col5a3Q9JLI2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col5a3Q9JLI2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col5a3Q9JLI2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col5a3Q9JLI2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col5a3Q9JLI2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col5a3Q9JLI2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col5a3Q9JLI2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col5a3Q9JLI2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col5a3Q9JLI2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col5a3Q9JLI2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col5a3Q9JLI2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Col5a3Q9JLI2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col5a3Q9JLI2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col5a3Q9JLI2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Col5a3Q9JLI2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Col5a3Q9JLI2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Col5a3Q9JLI2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Col5a3Q9JLI2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Col5a3Q9JLI2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Col5a3Q9JLI2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Col5a3Q9JLI2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col5a3Q9JLI2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col5a3Q9JLI2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col5a3Q9JLI2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col5a3Q9JLI2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col5a3Q9JLI2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col5a3Q9JLI2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col5a3Q9JLI2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col5a3Q9JLI2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col5a3Q9JLI2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Col5a3Q9JLI2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col5a3Q9JLI2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col5a3Q9JLI2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col5a3Q9JLI2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col5a3Q9JLI2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col5a3Q9JLI2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Col5a3Q9JLI2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col5a3Q9JLI2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col5a3Q9JLI2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col5a3Q9JLI2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col5a3Q9JLI2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col5a3Q9JLI2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col5a3Q9JLI2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col5a3Q9JLI2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col5a3Q9JLI2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col5a3Q9JLI2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col5a3Q9JLI2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col5a3Q9JLI2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col5a3Q9JLI2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col5a3Q9JLI2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col5a3Q9JLI2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col5a3Q9JLI2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col5a3Q9JLI2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col5a3Q9JLI2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col5a3Q9JLI2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col5a3Q9JLI2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col5a3Q9JLI2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col5a3Q9JLI2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col5a3Q9JLI2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col5a3Q9JLI2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col5a3Q9JLI2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col5a3Q9JLI2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col5a3Q9JLI2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col5a3Q9JLI2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col5a3Q9JLI2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col5a3Q9JLI2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col5a3Q9JLI2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col5a3Q9JLI2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col5a3Q9JLI2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col5a3Q9JLI2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col5a3Q9JLI2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col5a3Q9JLI2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col5a3Q9JLI2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Col5a3Q9JLI2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Col5a3Q9JLI2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Col5a3Q9JLI2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Col5a3Q9JLI2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Col5a3Q9JLI2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Col5a3Q9JLI2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Col5a3Q9JLI2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Col5a3Q9JLI2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Col5a3Q9JLI2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms