Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gpa33Q9JKA5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gpa33Q9JKA5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms