Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn19Q9ET38 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn19Q9ET38 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn19Q9ET38 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn19Q9ET38 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn19Q9ET38 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn19Q9ET38 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn19Q9ET38 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn19Q9ET38 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn19Q9ET38 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn19Q9ET38 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn19Q9ET38 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn19Q9ET38 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn19Q9ET38 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn19Q9ET38 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn19Q9ET38 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn19Q9ET38 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn19Q9ET38 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn19Q9ET38 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn19Q9ET38 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cldn19Q9ET38 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cldn19Q9ET38 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn19Q9ET38 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn19Q9ET38 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn19Q9ET38 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn19Q9ET38 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn19Q9ET38 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn19Q9ET38 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn19Q9ET38 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn19Q9ET38 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn19Q9ET38 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn19Q9ET38 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn19Q9ET38 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn19Q9ET38 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn19Q9ET38 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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Cldn19Q9ET38 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn19Q9ET38 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn19Q9ET38 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn19Q9ET38 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn19Q9ET38 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn19Q9ET38 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn19Q9ET38 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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Cldn19Q9ET38 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn19Q9ET38 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn19Q9ET38 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn19Q9ET38 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn19Q9ET38 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn19Q9ET38 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn19Q9ET38 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn19Q9ET38 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn19Q9ET38 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn19Q9ET38 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn19Q9ET38 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn19Q9ET38 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn19Q9ET38 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn19Q9ET38 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn19Q9ET38 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn19Q9ET38 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn19Q9ET38 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn19Q9ET38 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn19Q9ET38 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn19Q9ET38 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn19Q9ET38 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn19Q9ET38 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn19Q9ET38 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn19Q9ET38 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn19Q9ET38 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn19Q9ET38 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn19Q9ET38 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn19Q9ET38 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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