Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
OtofQ9ESF1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
OtofQ9ESF1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
OtofQ9ESF1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
OtofQ9ESF1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
OtofQ9ESF1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
OtofQ9ESF1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
OtofQ9ESF1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
OtofQ9ESF1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
OtofQ9ESF1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
OtofQ9ESF1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
OtofQ9ESF1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
OtofQ9ESF1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
OtofQ9ESF1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
OtofQ9ESF1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
OtofQ9ESF1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
OtofQ9ESF1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
OtofQ9ESF1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
OtofQ9ESF1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
OtofQ9ESF1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
OtofQ9ESF1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
OtofQ9ESF1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
OtofQ9ESF1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
OtofQ9ESF1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
OtofQ9ESF1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
OtofQ9ESF1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
OtofQ9ESF1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
OtofQ9ESF1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
OtofQ9ESF1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
OtofQ9ESF1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
OtofQ9ESF1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
OtofQ9ESF1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
OtofQ9ESF1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
OtofQ9ESF1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
OtofQ9ESF1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
OtofQ9ESF1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
OtofQ9ESF1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
OtofQ9ESF1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
OtofQ9ESF1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
OtofQ9ESF1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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