Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESC8

Aff4, AF4/FMR2 family member 4, mousemouse

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Length 1,160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff4Q9ESC8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aff4Q9ESC8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aff4Q9ESC8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aff4Q9ESC8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aff4Q9ESC8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aff4Q9ESC8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aff4Q9ESC8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aff4Q9ESC8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aff4Q9ESC8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aff4Q9ESC8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
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Aff4Q9ESC8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Aff4Q9ESC8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aff4Q9ESC8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aff4Q9ESC8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aff4Q9ESC8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aff4Q9ESC8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aff4Q9ESC8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aff4Q9ESC8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Aff4Q9ESC8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Aff4Q9ESC8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Aff4Q9ESC8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Aff4Q9ESC8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Aff4Q9ESC8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Aff4Q9ESC8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Aff4Q9ESC8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Aff4Q9ESC8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Aff4Q9ESC8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Aff4Q9ESC8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Aff4Q9ESC8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Aff4Q9ESC8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Aff4Q9ESC8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Aff4Q9ESC8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Aff4Q9ESC8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Aff4Q9ESC8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Aff4Q9ESC8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Aff4Q9ESC8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Aff4Q9ESC8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Aff4Q9ESC8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Aff4Q9ESC8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Aff4Q9ESC8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Aff4Q9ESC8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Aff4Q9ESC8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Aff4Q9ESC8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Aff4Q9ESC8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Aff4Q9ESC8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Aff4Q9ESC8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Aff4Q9ESC8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Aff4Q9ESC8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Aff4Q9ESC8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Aff4Q9ESC8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Aff4Q9ESC8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Aff4Q9ESC8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Aff4Q9ESC8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Aff4Q9ESC8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Aff4Q9ESC8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Aff4Q9ESC8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Aff4Q9ESC8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Aff4Q9ESC8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Aff4Q9ESC8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Aff4Q9ESC8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Aff4Q9ESC8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Aff4Q9ESC8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Aff4Q9ESC8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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