Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQI5

Ppbp, Chemokine (C-X-C motif) ligand 7, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpbpQ9EQI5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PpbpQ9EQI5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PpbpQ9EQI5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms