Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ47

Vmn1r44, Vomeronasal type-1 receptor 44, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r44Q9EQ47 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r44Q9EQ47 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r44Q9EQ47 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r44Q9EQ47 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r44Q9EQ47 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r44Q9EQ47 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r44Q9EQ47 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r44Q9EQ47 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r44Q9EQ47 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r44Q9EQ47 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r44Q9EQ47 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r44Q9EQ47 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r44Q9EQ47 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r44Q9EQ47 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r44Q9EQ47 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r44Q9EQ47 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r44Q9EQ47 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r44Q9EQ47 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r44Q9EQ47 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r44Q9EQ47 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r44Q9EQ47 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r44Q9EQ47 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r44Q9EQ47 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r44Q9EQ47 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r44Q9EQ47 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r44Q9EQ47 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r44Q9EQ47 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r44Q9EQ47 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r44Q9EQ47 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r44Q9EQ47 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r44Q9EQ47 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r44Q9EQ47 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms