Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SgshQ9EQ08 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SgshQ9EQ08 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SgshQ9EQ08 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SgshQ9EQ08 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SgshQ9EQ08 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SgshQ9EQ08 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SgshQ9EQ08 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SgshQ9EQ08 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SgshQ9EQ08 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SgshQ9EQ08 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SgshQ9EQ08 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SgshQ9EQ08 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
SgshQ9EQ08 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SgshQ9EQ08 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SgshQ9EQ08 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SgshQ9EQ08 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SgshQ9EQ08 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SgshQ9EQ08 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SgshQ9EQ08 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SgshQ9EQ08 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SgshQ9EQ08 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SgshQ9EQ08 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SgshQ9EQ08 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SgshQ9EQ08 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SgshQ9EQ08 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SgshQ9EQ08 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SgshQ9EQ08 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SgshQ9EQ08 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SgshQ9EQ08 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SgshQ9EQ08 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SgshQ9EQ08 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SgshQ9EQ08 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SgshQ9EQ08 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SgshQ9EQ08 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SgshQ9EQ08 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SgshQ9EQ08 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SgshQ9EQ08 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SgshQ9EQ08 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SgshQ9EQ08 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SgshQ9EQ08 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SgshQ9EQ08 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SgshQ9EQ08 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SgshQ9EQ08 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SgshQ9EQ08 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SgshQ9EQ08 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SgshQ9EQ08 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SgshQ9EQ08 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SgshQ9EQ08 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SgshQ9EQ08 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SgshQ9EQ08 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SgshQ9EQ08 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SgshQ9EQ08 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SgshQ9EQ08 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SgshQ9EQ08 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SgshQ9EQ08 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SgshQ9EQ08 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SgshQ9EQ08 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SgshQ9EQ08 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SgshQ9EQ08 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SgshQ9EQ08 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SgshQ9EQ08 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SgshQ9EQ08 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SgshQ9EQ08 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SgshQ9EQ08 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SgshQ9EQ08 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms