Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tlr1Q9EPQ1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr1Q9EPQ1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms