Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP51

Vmn1r50, Vomeronasal type-1 receptor 50, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r50Q9EP51 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r50Q9EP51 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r50Q9EP51 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r50Q9EP51 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r50Q9EP51 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r50Q9EP51 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r50Q9EP51 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r50Q9EP51 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r50Q9EP51 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r50Q9EP51 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r50Q9EP51 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r50Q9EP51 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r50Q9EP51 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r50Q9EP51 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r50Q9EP51 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r50Q9EP51 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r50Q9EP51 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r50Q9EP51 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r50Q9EP51 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r50Q9EP51 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r50Q9EP51 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r50Q9EP51 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r50Q9EP51 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r50Q9EP51 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r50Q9EP51 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r50Q9EP51 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r50Q9EP51 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r50Q9EP51 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r50Q9EP51 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r50Q9EP51 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r50Q9EP51 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r50Q9EP51 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r50Q9EP51 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r50Q9EP51 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r50Q9EP51 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r50Q9EP51 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r50Q9EP51 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r50Q9EP51 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r50Q9EP51 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 852.3 ms