Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCE5

Pak1ip1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak1ip1Q9DCE5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pak1ip1Q9DCE5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Pak1ip1Q9DCE5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pak1ip1Q9DCE5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pak1ip1Q9DCE5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pak1ip1Q9DCE5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pak1ip1Q9DCE5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pak1ip1Q9DCE5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pak1ip1Q9DCE5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pak1ip1Q9DCE5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pak1ip1Q9DCE5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pak1ip1Q9DCE5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pak1ip1Q9DCE5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pak1ip1Q9DCE5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pak1ip1Q9DCE5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pak1ip1Q9DCE5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pak1ip1Q9DCE5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pak1ip1Q9DCE5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pak1ip1Q9DCE5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pak1ip1Q9DCE5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pak1ip1Q9DCE5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pak1ip1Q9DCE5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pak1ip1Q9DCE5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pak1ip1Q9DCE5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pak1ip1Q9DCE5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pak1ip1Q9DCE5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pak1ip1Q9DCE5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pak1ip1Q9DCE5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pak1ip1Q9DCE5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pak1ip1Q9DCE5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pak1ip1Q9DCE5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Pak1ip1Q9DCE5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pak1ip1Q9DCE5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pak1ip1Q9DCE5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pak1ip1Q9DCE5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pak1ip1Q9DCE5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pak1ip1Q9DCE5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pak1ip1Q9DCE5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pak1ip1Q9DCE5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Pak1ip1Q9DCE5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pak1ip1Q9DCE5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pak1ip1Q9DCE5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pak1ip1Q9DCE5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pak1ip1Q9DCE5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pak1ip1Q9DCE5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pak1ip1Q9DCE5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pak1ip1Q9DCE5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pak1ip1Q9DCE5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Pak1ip1Q9DCE5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Pak1ip1Q9DCE5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pak1ip1Q9DCE5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pak1ip1Q9DCE5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pak1ip1Q9DCE5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pak1ip1Q9DCE5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pak1ip1Q9DCE5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pak1ip1Q9DCE5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pak1ip1Q9DCE5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pak1ip1Q9DCE5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pak1ip1Q9DCE5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Pak1ip1Q9DCE5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Pak1ip1Q9DCE5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pak1ip1Q9DCE5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pak1ip1Q9DCE5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pak1ip1Q9DCE5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pak1ip1Q9DCE5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pak1ip1Q9DCE5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pak1ip1Q9DCE5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pak1ip1Q9DCE5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pak1ip1Q9DCE5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pak1ip1Q9DCE5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pak1ip1Q9DCE5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pak1ip1Q9DCE5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pak1ip1Q9DCE5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pak1ip1Q9DCE5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pak1ip1Q9DCE5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pak1ip1Q9DCE5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pak1ip1Q9DCE5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pak1ip1Q9DCE5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pak1ip1Q9DCE5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Pak1ip1Q9DCE5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Pak1ip1Q9DCE5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Pak1ip1Q9DCE5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pak1ip1Q9DCE5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pak1ip1Q9DCE5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pak1ip1Q9DCE5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pak1ip1Q9DCE5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pak1ip1Q9DCE5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pak1ip1Q9DCE5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pak1ip1Q9DCE5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pak1ip1Q9DCE5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pak1ip1Q9DCE5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pak1ip1Q9DCE5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pak1ip1Q9DCE5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pak1ip1Q9DCE5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pak1ip1Q9DCE5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pak1ip1Q9DCE5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pak1ip1Q9DCE5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pak1ip1Q9DCE5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pak1ip1Q9DCE5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pak1ip1Q9DCE5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms