Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Med29Q9DB91 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Med29Q9DB91 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Med29Q9DB91 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Med29Q9DB91 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med29Q9DB91 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med29Q9DB91 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med29Q9DB91 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med29Q9DB91 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med29Q9DB91 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med29Q9DB91 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med29Q9DB91 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med29Q9DB91 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Med29Q9DB91 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med29Q9DB91 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med29Q9DB91 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med29Q9DB91 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med29Q9DB91 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Med29Q9DB91 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Med29Q9DB91 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Med29Q9DB91 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Med29Q9DB91 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Med29Q9DB91 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Med29Q9DB91 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Med29Q9DB91 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Med29Q9DB91 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Med29Q9DB91 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med29Q9DB91 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med29Q9DB91 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med29Q9DB91 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med29Q9DB91 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med29Q9DB91 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med29Q9DB91 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med29Q9DB91 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med29Q9DB91 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med29Q9DB91 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med29Q9DB91 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med29Q9DB91 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med29Q9DB91 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med29Q9DB91 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med29Q9DB91 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med29Q9DB91 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med29Q9DB91 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med29Q9DB91 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med29Q9DB91 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med29Q9DB91 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med29Q9DB91 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med29Q9DB91 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med29Q9DB91 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med29Q9DB91 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med29Q9DB91 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med29Q9DB91 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Med29Q9DB91 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med29Q9DB91 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med29Q9DB91 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med29Q9DB91 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med29Q9DB91 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med29Q9DB91 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med29Q9DB91 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med29Q9DB91 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms