Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smim23Q9DAL0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim23Q9DAL0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms