Protein–RNA interactions for Protein: Q9D806

Vstm5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm5Q9D806 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms