Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Speer4f1Q9D5Q6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Speer4f1Q9D5Q6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Speer4f1Q9D5Q6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Speer4f1Q9D5Q6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Speer4f1Q9D5Q6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Speer4f1Q9D5Q6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Speer4f1Q9D5Q6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Speer4f1Q9D5Q6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Speer4f1Q9D5Q6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Speer4f1Q9D5Q6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Speer4f1Q9D5Q6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Speer4f1Q9D5Q6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Speer4f1Q9D5Q6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Speer4f1Q9D5Q6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Speer4f1Q9D5Q6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Speer4f1Q9D5Q6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Speer4f1Q9D5Q6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Speer4f1Q9D5Q6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Speer4f1Q9D5Q6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Speer4f1Q9D5Q6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Speer4f1Q9D5Q6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Speer4f1Q9D5Q6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Speer4f1Q9D5Q6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Speer4f1Q9D5Q6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Speer4f1Q9D5Q6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Speer4f1Q9D5Q6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Speer4f1Q9D5Q6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Speer4f1Q9D5Q6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Speer4f1Q9D5Q6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Speer4f1Q9D5Q6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Speer4f1Q9D5Q6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Speer4f1Q9D5Q6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Speer4f1Q9D5Q6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Speer4f1Q9D5Q6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Speer4f1Q9D5Q6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Speer4f1Q9D5Q6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Speer4f1Q9D5Q6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Speer4f1Q9D5Q6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Speer4f1Q9D5Q6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Speer4f1Q9D5Q6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Speer4f1Q9D5Q6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Speer4f1Q9D5Q6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Speer4f1Q9D5Q6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Speer4f1Q9D5Q6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Speer4f1Q9D5Q6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Speer4f1Q9D5Q6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Speer4f1Q9D5Q6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Speer4f1Q9D5Q6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Speer4f1Q9D5Q6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Speer4f1Q9D5Q6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Speer4f1Q9D5Q6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Speer4f1Q9D5Q6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Speer4f1Q9D5Q6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Speer4f1Q9D5Q6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Speer4f1Q9D5Q6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Speer4f1Q9D5Q6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Speer4f1Q9D5Q6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Speer4f1Q9D5Q6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Speer4f1Q9D5Q6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Speer4f1Q9D5Q6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Speer4f1Q9D5Q6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Speer4f1Q9D5Q6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Speer4f1Q9D5Q6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Speer4f1Q9D5Q6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Speer4f1Q9D5Q6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Speer4f1Q9D5Q6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Speer4f1Q9D5Q6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Speer4f1Q9D5Q6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Speer4f1Q9D5Q6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Speer4f1Q9D5Q6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Speer4f1Q9D5Q6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Speer4f1Q9D5Q6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Speer4f1Q9D5Q6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Speer4f1Q9D5Q6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Speer4f1Q9D5Q6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Speer4f1Q9D5Q6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Speer4f1Q9D5Q6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Speer4f1Q9D5Q6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Speer4f1Q9D5Q6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Speer4f1Q9D5Q6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Speer4f1Q9D5Q6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Speer4f1Q9D5Q6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Speer4f1Q9D5Q6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Speer4f1Q9D5Q6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Speer4f1Q9D5Q6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Speer4f1Q9D5Q6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Speer4f1Q9D5Q6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Speer4f1Q9D5Q6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Speer4f1Q9D5Q6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Speer4f1Q9D5Q6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Speer4f1Q9D5Q6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Speer4f1Q9D5Q6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Speer4f1Q9D5Q6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Speer4f1Q9D5Q6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Speer4f1Q9D5Q6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Speer4f1Q9D5Q6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms