Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D2

4933402E13Rik, 4933402E13Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402E13RikQ9D4D2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
4933402E13RikQ9D4D2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
4933402E13RikQ9D4D2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4933402E13RikQ9D4D2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4933402E13RikQ9D4D2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4933402E13RikQ9D4D2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4933402E13RikQ9D4D2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4933402E13RikQ9D4D2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
4933402E13RikQ9D4D2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
4933402E13RikQ9D4D2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4933402E13RikQ9D4D2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4933402E13RikQ9D4D2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4933402E13RikQ9D4D2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
4933402E13RikQ9D4D2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4933402E13RikQ9D4D2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4933402E13RikQ9D4D2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
4933402E13RikQ9D4D2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4933402E13RikQ9D4D2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4933402E13RikQ9D4D2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4933402E13RikQ9D4D2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4933402E13RikQ9D4D2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
4933402E13RikQ9D4D2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4933402E13RikQ9D4D2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
4933402E13RikQ9D4D2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
4933402E13RikQ9D4D2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4933402E13RikQ9D4D2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4933402E13RikQ9D4D2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4933402E13RikQ9D4D2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
4933402E13RikQ9D4D2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4933402E13RikQ9D4D2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
4933402E13RikQ9D4D2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
4933402E13RikQ9D4D2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
4933402E13RikQ9D4D2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4933402E13RikQ9D4D2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
4933402E13RikQ9D4D2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
4933402E13RikQ9D4D2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4933402E13RikQ9D4D2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4933402E13RikQ9D4D2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
4933402E13RikQ9D4D2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4933402E13RikQ9D4D2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
4933402E13RikQ9D4D2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
4933402E13RikQ9D4D2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
4933402E13RikQ9D4D2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
4933402E13RikQ9D4D2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4933402E13RikQ9D4D2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4933402E13RikQ9D4D2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4933402E13RikQ9D4D2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
4933402E13RikQ9D4D2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
4933402E13RikQ9D4D2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4933402E13RikQ9D4D2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
4933402E13RikQ9D4D2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4933402E13RikQ9D4D2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4933402E13RikQ9D4D2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4933402E13RikQ9D4D2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4933402E13RikQ9D4D2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4933402E13RikQ9D4D2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
4933402E13RikQ9D4D2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4933402E13RikQ9D4D2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
4933402E13RikQ9D4D2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4933402E13RikQ9D4D2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4933402E13RikQ9D4D2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4933402E13RikQ9D4D2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4933402E13RikQ9D4D2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
4933402E13RikQ9D4D2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4933402E13RikQ9D4D2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
4933402E13RikQ9D4D2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4933402E13RikQ9D4D2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4933402E13RikQ9D4D2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4933402E13RikQ9D4D2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4933402E13RikQ9D4D2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
4933402E13RikQ9D4D2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4933402E13RikQ9D4D2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
4933402E13RikQ9D4D2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4933402E13RikQ9D4D2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
4933402E13RikQ9D4D2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4933402E13RikQ9D4D2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
4933402E13RikQ9D4D2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4933402E13RikQ9D4D2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4933402E13RikQ9D4D2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4933402E13RikQ9D4D2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
4933402E13RikQ9D4D2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4933402E13RikQ9D4D2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4933402E13RikQ9D4D2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4933402E13RikQ9D4D2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4933402E13RikQ9D4D2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4933402E13RikQ9D4D2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4933402E13RikQ9D4D2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
4933402E13RikQ9D4D2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4933402E13RikQ9D4D2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
4933402E13RikQ9D4D2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
4933402E13RikQ9D4D2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4933402E13RikQ9D4D2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
4933402E13RikQ9D4D2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
4933402E13RikQ9D4D2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
4933402E13RikQ9D4D2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
4933402E13RikQ9D4D2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4933402E13RikQ9D4D2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4933402E13RikQ9D4D2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
4933402E13RikQ9D4D2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms