Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pramef12Q9D2F1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pramef12Q9D2F1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pramef12Q9D2F1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pramef12Q9D2F1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pramef12Q9D2F1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pramef12Q9D2F1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pramef12Q9D2F1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pramef12Q9D2F1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pramef12Q9D2F1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pramef12Q9D2F1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pramef12Q9D2F1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pramef12Q9D2F1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pramef12Q9D2F1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pramef12Q9D2F1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pramef12Q9D2F1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pramef12Q9D2F1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pramef12Q9D2F1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pramef12Q9D2F1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pramef12Q9D2F1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pramef12Q9D2F1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pramef12Q9D2F1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pramef12Q9D2F1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pramef12Q9D2F1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pramef12Q9D2F1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pramef12Q9D2F1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pramef12Q9D2F1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pramef12Q9D2F1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pramef12Q9D2F1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pramef12Q9D2F1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pramef12Q9D2F1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pramef12Q9D2F1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pramef12Q9D2F1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pramef12Q9D2F1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pramef12Q9D2F1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pramef12Q9D2F1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pramef12Q9D2F1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pramef12Q9D2F1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pramef12Q9D2F1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pramef12Q9D2F1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pramef12Q9D2F1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pramef12Q9D2F1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pramef12Q9D2F1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pramef12Q9D2F1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pramef12Q9D2F1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pramef12Q9D2F1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pramef12Q9D2F1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pramef12Q9D2F1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pramef12Q9D2F1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pramef12Q9D2F1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pramef12Q9D2F1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pramef12Q9D2F1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pramef12Q9D2F1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pramef12Q9D2F1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pramef12Q9D2F1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pramef12Q9D2F1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pramef12Q9D2F1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pramef12Q9D2F1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pramef12Q9D2F1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pramef12Q9D2F1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pramef12Q9D2F1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pramef12Q9D2F1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pramef12Q9D2F1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pramef12Q9D2F1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pramef12Q9D2F1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pramef12Q9D2F1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pramef12Q9D2F1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pramef12Q9D2F1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms