Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nol3Q9D1X0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nol3Q9D1X0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms