Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ6

Mis18a, Protein Mis18-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis18aQ9CZJ6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mis18aQ9CZJ6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mis18aQ9CZJ6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mis18aQ9CZJ6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mis18aQ9CZJ6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Mis18aQ9CZJ6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Mis18aQ9CZJ6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mis18aQ9CZJ6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mis18aQ9CZJ6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mis18aQ9CZJ6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mis18aQ9CZJ6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mis18aQ9CZJ6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mis18aQ9CZJ6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mis18aQ9CZJ6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mis18aQ9CZJ6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mis18aQ9CZJ6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mis18aQ9CZJ6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mis18aQ9CZJ6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mis18aQ9CZJ6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mis18aQ9CZJ6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mis18aQ9CZJ6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mis18aQ9CZJ6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mis18aQ9CZJ6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Mis18aQ9CZJ6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mis18aQ9CZJ6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mis18aQ9CZJ6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mis18aQ9CZJ6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mis18aQ9CZJ6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mis18aQ9CZJ6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mis18aQ9CZJ6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mis18aQ9CZJ6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mis18aQ9CZJ6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mis18aQ9CZJ6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mis18aQ9CZJ6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mis18aQ9CZJ6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mis18aQ9CZJ6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mis18aQ9CZJ6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mis18aQ9CZJ6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mis18aQ9CZJ6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mis18aQ9CZJ6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mis18aQ9CZJ6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mis18aQ9CZJ6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mis18aQ9CZJ6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mis18aQ9CZJ6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mis18aQ9CZJ6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mis18aQ9CZJ6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mis18aQ9CZJ6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mis18aQ9CZJ6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mis18aQ9CZJ6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mis18aQ9CZJ6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mis18aQ9CZJ6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mis18aQ9CZJ6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mis18aQ9CZJ6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mis18aQ9CZJ6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mis18aQ9CZJ6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mis18aQ9CZJ6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mis18aQ9CZJ6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mis18aQ9CZJ6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mis18aQ9CZJ6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mis18aQ9CZJ6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mis18aQ9CZJ6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mis18aQ9CZJ6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mis18aQ9CZJ6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mis18aQ9CZJ6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mis18aQ9CZJ6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mis18aQ9CZJ6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mis18aQ9CZJ6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mis18aQ9CZJ6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mis18aQ9CZJ6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mis18aQ9CZJ6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mis18aQ9CZJ6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mis18aQ9CZJ6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mis18aQ9CZJ6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mis18aQ9CZJ6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mis18aQ9CZJ6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mis18aQ9CZJ6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mis18aQ9CZJ6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mis18aQ9CZJ6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mis18aQ9CZJ6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mis18aQ9CZJ6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mis18aQ9CZJ6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mis18aQ9CZJ6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mis18aQ9CZJ6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mis18aQ9CZJ6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mis18aQ9CZJ6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mis18aQ9CZJ6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mis18aQ9CZJ6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mis18aQ9CZJ6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mis18aQ9CZJ6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mis18aQ9CZJ6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mis18aQ9CZJ6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mis18aQ9CZJ6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mis18aQ9CZJ6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mis18aQ9CZJ6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mis18aQ9CZJ6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Mis18aQ9CZJ6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mis18aQ9CZJ6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mis18aQ9CZJ6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Mis18aQ9CZJ6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mis18aQ9CZJ6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms