Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Exo5Q9CXP9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Exo5Q9CXP9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Exo5Q9CXP9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Exo5Q9CXP9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Exo5Q9CXP9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Exo5Q9CXP9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Exo5Q9CXP9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Exo5Q9CXP9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Exo5Q9CXP9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Exo5Q9CXP9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Exo5Q9CXP9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Exo5Q9CXP9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Exo5Q9CXP9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Exo5Q9CXP9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Exo5Q9CXP9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Exo5Q9CXP9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Exo5Q9CXP9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Exo5Q9CXP9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Exo5Q9CXP9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Exo5Q9CXP9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Exo5Q9CXP9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Exo5Q9CXP9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Exo5Q9CXP9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Exo5Q9CXP9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Exo5Q9CXP9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Exo5Q9CXP9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Exo5Q9CXP9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Exo5Q9CXP9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Exo5Q9CXP9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Exo5Q9CXP9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Exo5Q9CXP9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Exo5Q9CXP9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Exo5Q9CXP9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Exo5Q9CXP9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Exo5Q9CXP9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Exo5Q9CXP9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Exo5Q9CXP9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Exo5Q9CXP9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Exo5Q9CXP9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Exo5Q9CXP9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Exo5Q9CXP9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Exo5Q9CXP9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Exo5Q9CXP9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Exo5Q9CXP9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Exo5Q9CXP9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Exo5Q9CXP9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Exo5Q9CXP9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Exo5Q9CXP9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms