Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddx28Q9CWT6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddx28Q9CWT6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddx28Q9CWT6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddx28Q9CWT6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ddx28Q9CWT6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ddx28Q9CWT6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ddx28Q9CWT6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ddx28Q9CWT6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ddx28Q9CWT6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ddx28Q9CWT6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ddx28Q9CWT6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ddx28Q9CWT6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ddx28Q9CWT6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ddx28Q9CWT6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ddx28Q9CWT6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ddx28Q9CWT6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ddx28Q9CWT6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ddx28Q9CWT6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ddx28Q9CWT6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ddx28Q9CWT6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ddx28Q9CWT6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ddx28Q9CWT6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ddx28Q9CWT6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ddx28Q9CWT6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ddx28Q9CWT6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ddx28Q9CWT6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ddx28Q9CWT6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ddx28Q9CWT6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ddx28Q9CWT6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ddx28Q9CWT6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddx28Q9CWT6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddx28Q9CWT6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddx28Q9CWT6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddx28Q9CWT6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddx28Q9CWT6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddx28Q9CWT6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddx28Q9CWT6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddx28Q9CWT6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddx28Q9CWT6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddx28Q9CWT6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ddx28Q9CWT6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ddx28Q9CWT6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ddx28Q9CWT6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ddx28Q9CWT6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ddx28Q9CWT6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ddx28Q9CWT6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ddx28Q9CWT6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ddx28Q9CWT6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ddx28Q9CWT6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ddx28Q9CWT6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ddx28Q9CWT6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ddx28Q9CWT6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ddx28Q9CWT6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ddx28Q9CWT6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddx28Q9CWT6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddx28Q9CWT6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddx28Q9CWT6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddx28Q9CWT6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddx28Q9CWT6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddx28Q9CWT6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddx28Q9CWT6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddx28Q9CWT6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddx28Q9CWT6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddx28Q9CWT6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddx28Q9CWT6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddx28Q9CWT6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddx28Q9CWT6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddx28Q9CWT6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddx28Q9CWT6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddx28Q9CWT6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddx28Q9CWT6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddx28Q9CWT6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddx28Q9CWT6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddx28Q9CWT6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddx28Q9CWT6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddx28Q9CWT6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddx28Q9CWT6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddx28Q9CWT6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddx28Q9CWT6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddx28Q9CWT6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddx28Q9CWT6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddx28Q9CWT6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddx28Q9CWT6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddx28Q9CWT6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddx28Q9CWT6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddx28Q9CWT6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx28Q9CWT6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx28Q9CWT6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx28Q9CWT6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx28Q9CWT6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx28Q9CWT6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx28Q9CWT6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx28Q9CWT6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx28Q9CWT6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx28Q9CWT6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx28Q9CWT6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx28Q9CWT6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx28Q9CWT6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx28Q9CWT6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms