Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Rrbp1Q99PL5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
Rrbp1Q99PL5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Rrbp1Q99PL5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Rrbp1Q99PL5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
Rrbp1Q99PL5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Rrbp1Q99PL5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Rrbp1Q99PL5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Rrbp1Q99PL5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
Rrbp1Q99PL5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Rrbp1Q99PL5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Rrbp1Q99PL5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Rrbp1Q99PL5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Rrbp1Q99PL5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Rrbp1Q99PL5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Rrbp1Q99PL5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Rrbp1Q99PL5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Rrbp1Q99PL5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
Rrbp1Q99PL5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Rrbp1Q99PL5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
Rrbp1Q99PL5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
Rrbp1Q99PL5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Rrbp1Q99PL5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Rrbp1Q99PL5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Rrbp1Q99PL5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Rrbp1Q99PL5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Rrbp1Q99PL5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Rrbp1Q99PL5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Rrbp1Q99PL5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Rrbp1Q99PL5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Rrbp1Q99PL5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Rrbp1Q99PL5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Rrbp1Q99PL5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Rrbp1Q99PL5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Rrbp1Q99PL5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Rrbp1Q99PL5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Rrbp1Q99PL5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Rrbp1Q99PL5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Rrbp1Q99PL5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Rrbp1Q99PL5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Rrbp1Q99PL5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Rrbp1Q99PL5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Rrbp1Q99PL5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Rrbp1Q99PL5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Rrbp1Q99PL5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Rrbp1Q99PL5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Rrbp1Q99PL5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Rrbp1Q99PL5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Rrbp1Q99PL5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Rrbp1Q99PL5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Rrbp1Q99PL5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Rrbp1Q99PL5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Rrbp1Q99PL5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Rrbp1Q99PL5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Rrbp1Q99PL5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Rrbp1Q99PL5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Rrbp1Q99PL5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Rrbp1Q99PL5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Rrbp1Q99PL5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Rrbp1Q99PL5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Rrbp1Q99PL5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Rrbp1Q99PL5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Rrbp1Q99PL5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Rrbp1Q99PL5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Rrbp1Q99PL5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Rrbp1Q99PL5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Rrbp1Q99PL5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Rrbp1Q99PL5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Rrbp1Q99PL5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
Rrbp1Q99PL5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Rrbp1Q99PL5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Rrbp1Q99PL5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Rrbp1Q99PL5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Rrbp1Q99PL5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Rrbp1Q99PL5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Rrbp1Q99PL5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Rrbp1Q99PL5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Rrbp1Q99PL5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Rrbp1Q99PL5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Rrbp1Q99PL5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Rrbp1Q99PL5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Rrbp1Q99PL5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Rrbp1Q99PL5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Rrbp1Q99PL5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Rrbp1Q99PL5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Rrbp1Q99PL5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Rrbp1Q99PL5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Rrbp1Q99PL5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Rrbp1Q99PL5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Rrbp1Q99PL5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Rrbp1Q99PL5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Rrbp1Q99PL5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
Rrbp1Q99PL5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Rrbp1Q99PL5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Rrbp1Q99PL5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Rrbp1Q99PL5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
Rrbp1Q99PL5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Rrbp1Q99PL5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Rrbp1Q99PL5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Rrbp1Q99PL5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.2 ms