Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim3Q99PE5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Smim3Q99PE5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim3Q99PE5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim3Q99PE5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim3Q99PE5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim3Q99PE5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim3Q99PE5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim3Q99PE5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim3Q99PE5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim3Q99PE5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim3Q99PE5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim3Q99PE5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim3Q99PE5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim3Q99PE5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim3Q99PE5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim3Q99PE5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim3Q99PE5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim3Q99PE5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim3Q99PE5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim3Q99PE5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim3Q99PE5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim3Q99PE5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim3Q99PE5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim3Q99PE5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim3Q99PE5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim3Q99PE5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim3Q99PE5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim3Q99PE5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim3Q99PE5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim3Q99PE5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim3Q99PE5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim3Q99PE5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim3Q99PE5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim3Q99PE5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim3Q99PE5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim3Q99PE5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim3Q99PE5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim3Q99PE5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim3Q99PE5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim3Q99PE5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim3Q99PE5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim3Q99PE5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim3Q99PE5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim3Q99PE5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim3Q99PE5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim3Q99PE5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim3Q99PE5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim3Q99PE5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim3Q99PE5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim3Q99PE5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim3Q99PE5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim3Q99PE5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smim3Q99PE5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Smim3Q99PE5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Smim3Q99PE5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim3Q99PE5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms