Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtpbp4Q99ME9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtpbp4Q99ME9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtpbp4Q99ME9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtpbp4Q99ME9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtpbp4Q99ME9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtpbp4Q99ME9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtpbp4Q99ME9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtpbp4Q99ME9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtpbp4Q99ME9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtpbp4Q99ME9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtpbp4Q99ME9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtpbp4Q99ME9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtpbp4Q99ME9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtpbp4Q99ME9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtpbp4Q99ME9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtpbp4Q99ME9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtpbp4Q99ME9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtpbp4Q99ME9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtpbp4Q99ME9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtpbp4Q99ME9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtpbp4Q99ME9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtpbp4Q99ME9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtpbp4Q99ME9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtpbp4Q99ME9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtpbp4Q99ME9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtpbp4Q99ME9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtpbp4Q99ME9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtpbp4Q99ME9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtpbp4Q99ME9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtpbp4Q99ME9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtpbp4Q99ME9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtpbp4Q99ME9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtpbp4Q99ME9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtpbp4Q99ME9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtpbp4Q99ME9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtpbp4Q99ME9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gtpbp4Q99ME9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gtpbp4Q99ME9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtpbp4Q99ME9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtpbp4Q99ME9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtpbp4Q99ME9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtpbp4Q99ME9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtpbp4Q99ME9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtpbp4Q99ME9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtpbp4Q99ME9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtpbp4Q99ME9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtpbp4Q99ME9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtpbp4Q99ME9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtpbp4Q99ME9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtpbp4Q99ME9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtpbp4Q99ME9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtpbp4Q99ME9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtpbp4Q99ME9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtpbp4Q99ME9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtpbp4Q99ME9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtpbp4Q99ME9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtpbp4Q99ME9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtpbp4Q99ME9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtpbp4Q99ME9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtpbp4Q99ME9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtpbp4Q99ME9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtpbp4Q99ME9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtpbp4Q99ME9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtpbp4Q99ME9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtpbp4Q99ME9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtpbp4Q99ME9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtpbp4Q99ME9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtpbp4Q99ME9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtpbp4Q99ME9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtpbp4Q99ME9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtpbp4Q99ME9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtpbp4Q99ME9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtpbp4Q99ME9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtpbp4Q99ME9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtpbp4Q99ME9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtpbp4Q99ME9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtpbp4Q99ME9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtpbp4Q99ME9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtpbp4Q99ME9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtpbp4Q99ME9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtpbp4Q99ME9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtpbp4Q99ME9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtpbp4Q99ME9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtpbp4Q99ME9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtpbp4Q99ME9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtpbp4Q99ME9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtpbp4Q99ME9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtpbp4Q99ME9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtpbp4Q99ME9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtpbp4Q99ME9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtpbp4Q99ME9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gtpbp4Q99ME9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gtpbp4Q99ME9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtpbp4Q99ME9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtpbp4Q99ME9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtpbp4Q99ME9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtpbp4Q99ME9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtpbp4Q99ME9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtpbp4Q99ME9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms