Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Nlgn1Q99K10 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nlgn1Q99K10 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nlgn1Q99K10 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nlgn1Q99K10 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nlgn1Q99K10 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Nlgn1Q99K10 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nlgn1Q99K10 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nlgn1Q99K10 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nlgn1Q99K10 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nlgn1Q99K10 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nlgn1Q99K10 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nlgn1Q99K10 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Nlgn1Q99K10 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nlgn1Q99K10 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nlgn1Q99K10 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nlgn1Q99K10 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nlgn1Q99K10 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nlgn1Q99K10 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Nlgn1Q99K10 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nlgn1Q99K10 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nlgn1Q99K10 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nlgn1Q99K10 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nlgn1Q99K10 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nlgn1Q99K10 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nlgn1Q99K10 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nlgn1Q99K10 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nlgn1Q99K10 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nlgn1Q99K10 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nlgn1Q99K10 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Nlgn1Q99K10 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nlgn1Q99K10 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nlgn1Q99K10 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nlgn1Q99K10 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nlgn1Q99K10 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nlgn1Q99K10 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nlgn1Q99K10 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nlgn1Q99K10 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nlgn1Q99K10 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nlgn1Q99K10 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nlgn1Q99K10 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nlgn1Q99K10 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nlgn1Q99K10 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nlgn1Q99K10 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nlgn1Q99K10 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nlgn1Q99K10 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nlgn1Q99K10 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nlgn1Q99K10 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nlgn1Q99K10 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nlgn1Q99K10 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Nlgn1Q99K10 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Nlgn1Q99K10 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nlgn1Q99K10 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nlgn1Q99K10 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nlgn1Q99K10 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nlgn1Q99K10 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nlgn1Q99K10 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nlgn1Q99K10 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nlgn1Q99K10 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nlgn1Q99K10 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nlgn1Q99K10 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nlgn1Q99K10 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nlgn1Q99K10 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nlgn1Q99K10 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nlgn1Q99K10 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nlgn1Q99K10 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nlgn1Q99K10 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nlgn1Q99K10 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nlgn1Q99K10 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nlgn1Q99K10 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Nlgn1Q99K10 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nlgn1Q99K10 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nlgn1Q99K10 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nlgn1Q99K10 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nlgn1Q99K10 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nlgn1Q99K10 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nlgn1Q99K10 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nlgn1Q99K10 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nlgn1Q99K10 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nlgn1Q99K10 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Nlgn1Q99K10 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nlgn1Q99K10 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nlgn1Q99K10 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nlgn1Q99K10 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nlgn1Q99K10 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nlgn1Q99K10 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nlgn1Q99K10 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nlgn1Q99K10 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nlgn1Q99K10 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nlgn1Q99K10 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nlgn1Q99K10 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nlgn1Q99K10 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nlgn1Q99K10 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nlgn1Q99K10 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nlgn1Q99K10 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nlgn1Q99K10 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nlgn1Q99K10 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nlgn1Q99K10 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nlgn1Q99K10 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nlgn1Q99K10 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms