Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snx15Q91WE1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx15Q91WE1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx15Q91WE1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx15Q91WE1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx15Q91WE1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx15Q91WE1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx15Q91WE1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx15Q91WE1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx15Q91WE1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx15Q91WE1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx15Q91WE1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx15Q91WE1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx15Q91WE1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx15Q91WE1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx15Q91WE1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx15Q91WE1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx15Q91WE1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx15Q91WE1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx15Q91WE1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx15Q91WE1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx15Q91WE1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx15Q91WE1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx15Q91WE1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx15Q91WE1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx15Q91WE1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx15Q91WE1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Snx15Q91WE1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx15Q91WE1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx15Q91WE1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx15Q91WE1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx15Q91WE1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx15Q91WE1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx15Q91WE1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx15Q91WE1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx15Q91WE1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx15Q91WE1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx15Q91WE1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx15Q91WE1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx15Q91WE1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx15Q91WE1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx15Q91WE1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx15Q91WE1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx15Q91WE1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx15Q91WE1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx15Q91WE1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx15Q91WE1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx15Q91WE1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx15Q91WE1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx15Q91WE1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx15Q91WE1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx15Q91WE1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx15Q91WE1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx15Q91WE1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx15Q91WE1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx15Q91WE1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx15Q91WE1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx15Q91WE1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx15Q91WE1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx15Q91WE1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx15Q91WE1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx15Q91WE1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx15Q91WE1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx15Q91WE1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx15Q91WE1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx15Q91WE1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx15Q91WE1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx15Q91WE1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx15Q91WE1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx15Q91WE1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx15Q91WE1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx15Q91WE1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx15Q91WE1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx15Q91WE1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx15Q91WE1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx15Q91WE1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx15Q91WE1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx15Q91WE1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Snx15Q91WE1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Snx15Q91WE1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx15Q91WE1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms