Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS7

Cep57l1, Centrosomal protein CEP57L1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep57l1Q8VDS7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cep57l1Q8VDS7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cep57l1Q8VDS7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cep57l1Q8VDS7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cep57l1Q8VDS7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cep57l1Q8VDS7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cep57l1Q8VDS7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cep57l1Q8VDS7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cep57l1Q8VDS7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cep57l1Q8VDS7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cep57l1Q8VDS7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cep57l1Q8VDS7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cep57l1Q8VDS7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cep57l1Q8VDS7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cep57l1Q8VDS7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cep57l1Q8VDS7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cep57l1Q8VDS7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cep57l1Q8VDS7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cep57l1Q8VDS7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cep57l1Q8VDS7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cep57l1Q8VDS7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cep57l1Q8VDS7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cep57l1Q8VDS7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cep57l1Q8VDS7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cep57l1Q8VDS7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cep57l1Q8VDS7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cep57l1Q8VDS7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cep57l1Q8VDS7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cep57l1Q8VDS7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cep57l1Q8VDS7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cep57l1Q8VDS7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cep57l1Q8VDS7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cep57l1Q8VDS7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cep57l1Q8VDS7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cep57l1Q8VDS7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cep57l1Q8VDS7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cep57l1Q8VDS7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cep57l1Q8VDS7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cep57l1Q8VDS7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cep57l1Q8VDS7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cep57l1Q8VDS7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cep57l1Q8VDS7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cep57l1Q8VDS7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cep57l1Q8VDS7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cep57l1Q8VDS7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cep57l1Q8VDS7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cep57l1Q8VDS7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cep57l1Q8VDS7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cep57l1Q8VDS7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cep57l1Q8VDS7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cep57l1Q8VDS7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cep57l1Q8VDS7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cep57l1Q8VDS7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cep57l1Q8VDS7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cep57l1Q8VDS7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cep57l1Q8VDS7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cep57l1Q8VDS7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cep57l1Q8VDS7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cep57l1Q8VDS7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cep57l1Q8VDS7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cep57l1Q8VDS7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cep57l1Q8VDS7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cep57l1Q8VDS7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cep57l1Q8VDS7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cep57l1Q8VDS7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cep57l1Q8VDS7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cep57l1Q8VDS7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cep57l1Q8VDS7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cep57l1Q8VDS7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cep57l1Q8VDS7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cep57l1Q8VDS7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cep57l1Q8VDS7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cep57l1Q8VDS7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cep57l1Q8VDS7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cep57l1Q8VDS7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cep57l1Q8VDS7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cep57l1Q8VDS7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cep57l1Q8VDS7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cep57l1Q8VDS7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cep57l1Q8VDS7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cep57l1Q8VDS7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cep57l1Q8VDS7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cep57l1Q8VDS7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cep57l1Q8VDS7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cep57l1Q8VDS7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cep57l1Q8VDS7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cep57l1Q8VDS7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cep57l1Q8VDS7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cep57l1Q8VDS7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cep57l1Q8VDS7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cep57l1Q8VDS7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cep57l1Q8VDS7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cep57l1Q8VDS7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cep57l1Q8VDS7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cep57l1Q8VDS7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cep57l1Q8VDS7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cep57l1Q8VDS7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cep57l1Q8VDS7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cep57l1Q8VDS7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cep57l1Q8VDS7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms