Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDN2

Atp1a1, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a1Q8VDN2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Atp1a1Q8VDN2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp1a1Q8VDN2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp1a1Q8VDN2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp1a1Q8VDN2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp1a1Q8VDN2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp1a1Q8VDN2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp1a1Q8VDN2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp1a1Q8VDN2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp1a1Q8VDN2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp1a1Q8VDN2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp1a1Q8VDN2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp1a1Q8VDN2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp1a1Q8VDN2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp1a1Q8VDN2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp1a1Q8VDN2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp1a1Q8VDN2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp1a1Q8VDN2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp1a1Q8VDN2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp1a1Q8VDN2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp1a1Q8VDN2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp1a1Q8VDN2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp1a1Q8VDN2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp1a1Q8VDN2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp1a1Q8VDN2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp1a1Q8VDN2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp1a1Q8VDN2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp1a1Q8VDN2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp1a1Q8VDN2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp1a1Q8VDN2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp1a1Q8VDN2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp1a1Q8VDN2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp1a1Q8VDN2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp1a1Q8VDN2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp1a1Q8VDN2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp1a1Q8VDN2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp1a1Q8VDN2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp1a1Q8VDN2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp1a1Q8VDN2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp1a1Q8VDN2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp1a1Q8VDN2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp1a1Q8VDN2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp1a1Q8VDN2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp1a1Q8VDN2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp1a1Q8VDN2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp1a1Q8VDN2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp1a1Q8VDN2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp1a1Q8VDN2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp1a1Q8VDN2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp1a1Q8VDN2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp1a1Q8VDN2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp1a1Q8VDN2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp1a1Q8VDN2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp1a1Q8VDN2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp1a1Q8VDN2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp1a1Q8VDN2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp1a1Q8VDN2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atp1a1Q8VDN2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atp1a1Q8VDN2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp1a1Q8VDN2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp1a1Q8VDN2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp1a1Q8VDN2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp1a1Q8VDN2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp1a1Q8VDN2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp1a1Q8VDN2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp1a1Q8VDN2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp1a1Q8VDN2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp1a1Q8VDN2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp1a1Q8VDN2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp1a1Q8VDN2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp1a1Q8VDN2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp1a1Q8VDN2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp1a1Q8VDN2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp1a1Q8VDN2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp1a1Q8VDN2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp1a1Q8VDN2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp1a1Q8VDN2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp1a1Q8VDN2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp1a1Q8VDN2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp1a1Q8VDN2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp1a1Q8VDN2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp1a1Q8VDN2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp1a1Q8VDN2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp1a1Q8VDN2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp1a1Q8VDN2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp1a1Q8VDN2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp1a1Q8VDN2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp1a1Q8VDN2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp1a1Q8VDN2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp1a1Q8VDN2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp1a1Q8VDN2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp1a1Q8VDN2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp1a1Q8VDN2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp1a1Q8VDN2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp1a1Q8VDN2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp1a1Q8VDN2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp1a1Q8VDN2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp1a1Q8VDN2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp1a1Q8VDN2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp1a1Q8VDN2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 635.8 ms