Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3L8

Cdk8, Cyclin-dependent kinase 8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk8Q8R3L8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk8Q8R3L8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk8Q8R3L8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk8Q8R3L8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk8Q8R3L8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk8Q8R3L8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk8Q8R3L8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk8Q8R3L8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk8Q8R3L8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk8Q8R3L8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdk8Q8R3L8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdk8Q8R3L8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdk8Q8R3L8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdk8Q8R3L8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdk8Q8R3L8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdk8Q8R3L8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdk8Q8R3L8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk8Q8R3L8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk8Q8R3L8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk8Q8R3L8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk8Q8R3L8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk8Q8R3L8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk8Q8R3L8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk8Q8R3L8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdk8Q8R3L8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdk8Q8R3L8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdk8Q8R3L8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdk8Q8R3L8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdk8Q8R3L8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdk8Q8R3L8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdk8Q8R3L8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdk8Q8R3L8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk8Q8R3L8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk8Q8R3L8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Cdk8Q8R3L8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk8Q8R3L8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk8Q8R3L8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk8Q8R3L8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk8Q8R3L8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk8Q8R3L8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk8Q8R3L8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk8Q8R3L8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk8Q8R3L8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk8Q8R3L8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk8Q8R3L8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk8Q8R3L8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk8Q8R3L8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk8Q8R3L8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk8Q8R3L8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk8Q8R3L8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk8Q8R3L8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk8Q8R3L8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk8Q8R3L8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk8Q8R3L8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk8Q8R3L8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk8Q8R3L8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk8Q8R3L8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk8Q8R3L8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk8Q8R3L8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk8Q8R3L8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk8Q8R3L8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk8Q8R3L8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk8Q8R3L8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk8Q8R3L8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk8Q8R3L8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk8Q8R3L8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk8Q8R3L8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk8Q8R3L8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk8Q8R3L8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk8Q8R3L8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdk8Q8R3L8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk8Q8R3L8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk8Q8R3L8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk8Q8R3L8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk8Q8R3L8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk8Q8R3L8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk8Q8R3L8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk8Q8R3L8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk8Q8R3L8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk8Q8R3L8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk8Q8R3L8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk8Q8R3L8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk8Q8R3L8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdk8Q8R3L8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk8Q8R3L8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk8Q8R3L8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk8Q8R3L8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk8Q8R3L8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk8Q8R3L8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk8Q8R3L8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cdk8Q8R3L8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cdk8Q8R3L8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk8Q8R3L8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk8Q8R3L8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk8Q8R3L8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk8Q8R3L8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk8Q8R3L8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk8Q8R3L8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk8Q8R3L8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk8Q8R3L8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms