Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Q9

Shtn1, Shootin-1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shtn1Q8K2Q9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Shtn1Q8K2Q9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Shtn1Q8K2Q9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Shtn1Q8K2Q9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Shtn1Q8K2Q9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Shtn1Q8K2Q9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Shtn1Q8K2Q9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Shtn1Q8K2Q9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Shtn1Q8K2Q9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Shtn1Q8K2Q9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Shtn1Q8K2Q9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Shtn1Q8K2Q9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Shtn1Q8K2Q9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Shtn1Q8K2Q9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Shtn1Q8K2Q9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Shtn1Q8K2Q9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Shtn1Q8K2Q9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Shtn1Q8K2Q9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Shtn1Q8K2Q9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Shtn1Q8K2Q9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Shtn1Q8K2Q9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Shtn1Q8K2Q9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Shtn1Q8K2Q9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Shtn1Q8K2Q9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Shtn1Q8K2Q9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Shtn1Q8K2Q9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Shtn1Q8K2Q9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Shtn1Q8K2Q9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Shtn1Q8K2Q9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Shtn1Q8K2Q9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Shtn1Q8K2Q9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Shtn1Q8K2Q9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Shtn1Q8K2Q9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Shtn1Q8K2Q9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Shtn1Q8K2Q9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Shtn1Q8K2Q9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Shtn1Q8K2Q9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Shtn1Q8K2Q9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Shtn1Q8K2Q9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Shtn1Q8K2Q9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Shtn1Q8K2Q9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Shtn1Q8K2Q9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Shtn1Q8K2Q9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Shtn1Q8K2Q9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Shtn1Q8K2Q9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Shtn1Q8K2Q9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Shtn1Q8K2Q9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Shtn1Q8K2Q9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Shtn1Q8K2Q9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Shtn1Q8K2Q9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Shtn1Q8K2Q9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Shtn1Q8K2Q9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Shtn1Q8K2Q9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Shtn1Q8K2Q9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Shtn1Q8K2Q9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Shtn1Q8K2Q9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Shtn1Q8K2Q9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Shtn1Q8K2Q9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Shtn1Q8K2Q9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Shtn1Q8K2Q9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Shtn1Q8K2Q9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Shtn1Q8K2Q9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Shtn1Q8K2Q9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Shtn1Q8K2Q9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Shtn1Q8K2Q9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Shtn1Q8K2Q9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Shtn1Q8K2Q9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Shtn1Q8K2Q9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Shtn1Q8K2Q9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Shtn1Q8K2Q9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Shtn1Q8K2Q9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Shtn1Q8K2Q9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Shtn1Q8K2Q9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Shtn1Q8K2Q9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Shtn1Q8K2Q9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Shtn1Q8K2Q9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Shtn1Q8K2Q9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Shtn1Q8K2Q9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Shtn1Q8K2Q9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Shtn1Q8K2Q9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Shtn1Q8K2Q9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Shtn1Q8K2Q9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Shtn1Q8K2Q9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Shtn1Q8K2Q9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Shtn1Q8K2Q9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Shtn1Q8K2Q9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Shtn1Q8K2Q9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Shtn1Q8K2Q9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Shtn1Q8K2Q9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Shtn1Q8K2Q9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Shtn1Q8K2Q9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Shtn1Q8K2Q9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Shtn1Q8K2Q9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Shtn1Q8K2Q9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Shtn1Q8K2Q9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Shtn1Q8K2Q9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Shtn1Q8K2Q9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Shtn1Q8K2Q9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Shtn1Q8K2Q9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Shtn1Q8K2Q9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms