Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brd3Q8K2F0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brd3Q8K2F0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brd3Q8K2F0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brd3Q8K2F0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brd3Q8K2F0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brd3Q8K2F0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brd3Q8K2F0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brd3Q8K2F0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brd3Q8K2F0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brd3Q8K2F0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brd3Q8K2F0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brd3Q8K2F0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brd3Q8K2F0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brd3Q8K2F0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brd3Q8K2F0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brd3Q8K2F0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brd3Q8K2F0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brd3Q8K2F0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brd3Q8K2F0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brd3Q8K2F0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Brd3Q8K2F0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Brd3Q8K2F0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Brd3Q8K2F0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brd3Q8K2F0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brd3Q8K2F0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brd3Q8K2F0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brd3Q8K2F0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brd3Q8K2F0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brd3Q8K2F0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brd3Q8K2F0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brd3Q8K2F0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brd3Q8K2F0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brd3Q8K2F0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brd3Q8K2F0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brd3Q8K2F0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brd3Q8K2F0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brd3Q8K2F0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brd3Q8K2F0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brd3Q8K2F0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brd3Q8K2F0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brd3Q8K2F0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brd3Q8K2F0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brd3Q8K2F0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brd3Q8K2F0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brd3Q8K2F0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brd3Q8K2F0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brd3Q8K2F0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Brd3Q8K2F0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brd3Q8K2F0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brd3Q8K2F0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brd3Q8K2F0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brd3Q8K2F0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brd3Q8K2F0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brd3Q8K2F0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brd3Q8K2F0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brd3Q8K2F0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brd3Q8K2F0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brd3Q8K2F0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brd3Q8K2F0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brd3Q8K2F0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brd3Q8K2F0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brd3Q8K2F0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brd3Q8K2F0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brd3Q8K2F0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brd3Q8K2F0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brd3Q8K2F0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brd3Q8K2F0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brd3Q8K2F0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brd3Q8K2F0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brd3Q8K2F0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brd3Q8K2F0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brd3Q8K2F0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brd3Q8K2F0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brd3Q8K2F0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms