Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc4a8Q8JZR6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc4a8Q8JZR6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc4a8Q8JZR6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc4a8Q8JZR6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc4a8Q8JZR6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc4a8Q8JZR6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc4a8Q8JZR6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc4a8Q8JZR6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc4a8Q8JZR6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc4a8Q8JZR6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc4a8Q8JZR6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc4a8Q8JZR6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc4a8Q8JZR6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc4a8Q8JZR6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc4a8Q8JZR6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc4a8Q8JZR6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc4a8Q8JZR6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc4a8Q8JZR6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc4a8Q8JZR6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc4a8Q8JZR6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc4a8Q8JZR6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc4a8Q8JZR6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc4a8Q8JZR6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc4a8Q8JZR6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc4a8Q8JZR6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc4a8Q8JZR6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc4a8Q8JZR6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc4a8Q8JZR6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc4a8Q8JZR6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc4a8Q8JZR6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc4a8Q8JZR6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc4a8Q8JZR6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc4a8Q8JZR6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc4a8Q8JZR6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc4a8Q8JZR6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc4a8Q8JZR6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc4a8Q8JZR6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc4a8Q8JZR6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc4a8Q8JZR6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc4a8Q8JZR6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc4a8Q8JZR6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc4a8Q8JZR6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc4a8Q8JZR6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc4a8Q8JZR6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc4a8Q8JZR6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc4a8Q8JZR6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc4a8Q8JZR6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc4a8Q8JZR6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc4a8Q8JZR6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc4a8Q8JZR6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc4a8Q8JZR6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc4a8Q8JZR6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc4a8Q8JZR6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc4a8Q8JZR6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc4a8Q8JZR6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc4a8Q8JZR6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc4a8Q8JZR6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc4a8Q8JZR6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc4a8Q8JZR6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc4a8Q8JZR6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc4a8Q8JZR6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc4a8Q8JZR6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc4a8Q8JZR6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc4a8Q8JZR6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc4a8Q8JZR6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc4a8Q8JZR6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc4a8Q8JZR6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc4a8Q8JZR6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc4a8Q8JZR6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc4a8Q8JZR6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc4a8Q8JZR6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc4a8Q8JZR6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc4a8Q8JZR6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc4a8Q8JZR6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc4a8Q8JZR6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc4a8Q8JZR6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc4a8Q8JZR6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc4a8Q8JZR6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc4a8Q8JZR6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc4a8Q8JZR6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc4a8Q8JZR6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc4a8Q8JZR6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc4a8Q8JZR6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc4a8Q8JZR6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc4a8Q8JZR6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc4a8Q8JZR6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc4a8Q8JZR6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc4a8Q8JZR6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc4a8Q8JZR6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc4a8Q8JZR6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slc4a8Q8JZR6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slc4a8Q8JZR6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slc4a8Q8JZR6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc4a8Q8JZR6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc4a8Q8JZR6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc4a8Q8JZR6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc4a8Q8JZR6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc4a8Q8JZR6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc4a8Q8JZR6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms