Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp27Q8CEG8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp27Q8CEG8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp27Q8CEG8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp27Q8CEG8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp27Q8CEG8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp27Q8CEG8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp27Q8CEG8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp27Q8CEG8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp27Q8CEG8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp27Q8CEG8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp27Q8CEG8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp27Q8CEG8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp27Q8CEG8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp27Q8CEG8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp27Q8CEG8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp27Q8CEG8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp27Q8CEG8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp27Q8CEG8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp27Q8CEG8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp27Q8CEG8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp27Q8CEG8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp27Q8CEG8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp27Q8CEG8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp27Q8CEG8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp27Q8CEG8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp27Q8CEG8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp27Q8CEG8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp27Q8CEG8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp27Q8CEG8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp27Q8CEG8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp27Q8CEG8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp27Q8CEG8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp27Q8CEG8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp27Q8CEG8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Usp27Q8CEG8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Usp27Q8CEG8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp27Q8CEG8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp27Q8CEG8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp27Q8CEG8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp27Q8CEG8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp27Q8CEG8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp27Q8CEG8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp27Q8CEG8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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Usp27Q8CEG8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp27Q8CEG8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp27Q8CEG8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp27Q8CEG8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp27Q8CEG8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp27Q8CEG8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp27Q8CEG8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp27Q8CEG8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp27Q8CEG8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp27Q8CEG8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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Usp27Q8CEG8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp27Q8CEG8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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Usp27Q8CEG8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp27Q8CEG8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp27Q8CEG8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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Usp27Q8CEG8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp27Q8CEG8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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Usp27Q8CEG8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp27Q8CEG8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp27Q8CEG8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp27Q8CEG8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp27Q8CEG8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp27Q8CEG8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp27Q8CEG8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp27Q8CEG8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp27Q8CEG8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp27Q8CEG8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp27Q8CEG8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp27Q8CEG8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp27Q8CEG8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp27Q8CEG8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp27Q8CEG8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp27Q8CEG8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp27Q8CEG8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp27Q8CEG8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp27Q8CEG8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp27Q8CEG8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp27Q8CEG8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp27Q8CEG8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp27Q8CEG8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp27Q8CEG8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp27Q8CEG8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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