Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfibp1Q8C8U0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfibp1Q8C8U0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfibp1Q8C8U0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfibp1Q8C8U0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfibp1Q8C8U0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfibp1Q8C8U0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfibp1Q8C8U0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppfibp1Q8C8U0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppfibp1Q8C8U0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppfibp1Q8C8U0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppfibp1Q8C8U0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppfibp1Q8C8U0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppfibp1Q8C8U0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppfibp1Q8C8U0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppfibp1Q8C8U0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppfibp1Q8C8U0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppfibp1Q8C8U0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppfibp1Q8C8U0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppfibp1Q8C8U0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppfibp1Q8C8U0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppfibp1Q8C8U0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppfibp1Q8C8U0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppfibp1Q8C8U0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppfibp1Q8C8U0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppfibp1Q8C8U0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppfibp1Q8C8U0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppfibp1Q8C8U0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppfibp1Q8C8U0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppfibp1Q8C8U0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppfibp1Q8C8U0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppfibp1Q8C8U0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppfibp1Q8C8U0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppfibp1Q8C8U0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppfibp1Q8C8U0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppfibp1Q8C8U0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppfibp1Q8C8U0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppfibp1Q8C8U0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppfibp1Q8C8U0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppfibp1Q8C8U0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppfibp1Q8C8U0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppfibp1Q8C8U0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppfibp1Q8C8U0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppfibp1Q8C8U0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppfibp1Q8C8U0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppfibp1Q8C8U0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppfibp1Q8C8U0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppfibp1Q8C8U0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppfibp1Q8C8U0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppfibp1Q8C8U0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppfibp1Q8C8U0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppfibp1Q8C8U0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppfibp1Q8C8U0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppfibp1Q8C8U0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppfibp1Q8C8U0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppfibp1Q8C8U0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppfibp1Q8C8U0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppfibp1Q8C8U0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppfibp1Q8C8U0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppfibp1Q8C8U0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppfibp1Q8C8U0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppfibp1Q8C8U0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppfibp1Q8C8U0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppfibp1Q8C8U0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppfibp1Q8C8U0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppfibp1Q8C8U0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppfibp1Q8C8U0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppfibp1Q8C8U0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppfibp1Q8C8U0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppfibp1Q8C8U0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppfibp1Q8C8U0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppfibp1Q8C8U0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppfibp1Q8C8U0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppfibp1Q8C8U0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppfibp1Q8C8U0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppfibp1Q8C8U0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppfibp1Q8C8U0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppfibp1Q8C8U0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppfibp1Q8C8U0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppfibp1Q8C8U0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppfibp1Q8C8U0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppfibp1Q8C8U0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppfibp1Q8C8U0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppfibp1Q8C8U0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppfibp1Q8C8U0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppfibp1Q8C8U0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppfibp1Q8C8U0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppfibp1Q8C8U0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppfibp1Q8C8U0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppfibp1Q8C8U0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppfibp1Q8C8U0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppfibp1Q8C8U0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppfibp1Q8C8U0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppfibp1Q8C8U0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppfibp1Q8C8U0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppfibp1Q8C8U0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppfibp1Q8C8U0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms