Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Cwc22Q8C5N3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cwc22Q8C5N3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Cwc22Q8C5N3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cwc22Q8C5N3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Cwc22Q8C5N3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cwc22Q8C5N3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cwc22Q8C5N3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cwc22Q8C5N3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cwc22Q8C5N3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cwc22Q8C5N3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cwc22Q8C5N3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Cwc22Q8C5N3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cwc22Q8C5N3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cwc22Q8C5N3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Cwc22Q8C5N3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cwc22Q8C5N3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Cwc22Q8C5N3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cwc22Q8C5N3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cwc22Q8C5N3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cwc22Q8C5N3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cwc22Q8C5N3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cwc22Q8C5N3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cwc22Q8C5N3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cwc22Q8C5N3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cwc22Q8C5N3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cwc22Q8C5N3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cwc22Q8C5N3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cwc22Q8C5N3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cwc22Q8C5N3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cwc22Q8C5N3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cwc22Q8C5N3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cwc22Q8C5N3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cwc22Q8C5N3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cwc22Q8C5N3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cwc22Q8C5N3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cwc22Q8C5N3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cwc22Q8C5N3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cwc22Q8C5N3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cwc22Q8C5N3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cwc22Q8C5N3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cwc22Q8C5N3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cwc22Q8C5N3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Cwc22Q8C5N3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cwc22Q8C5N3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cwc22Q8C5N3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cwc22Q8C5N3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cwc22Q8C5N3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Cwc22Q8C5N3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cwc22Q8C5N3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cwc22Q8C5N3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cwc22Q8C5N3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cwc22Q8C5N3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cwc22Q8C5N3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cwc22Q8C5N3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cwc22Q8C5N3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Cwc22Q8C5N3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cwc22Q8C5N3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cwc22Q8C5N3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cwc22Q8C5N3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cwc22Q8C5N3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cwc22Q8C5N3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cwc22Q8C5N3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cwc22Q8C5N3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cwc22Q8C5N3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cwc22Q8C5N3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cwc22Q8C5N3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cwc22Q8C5N3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cwc22Q8C5N3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cwc22Q8C5N3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cwc22Q8C5N3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cwc22Q8C5N3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cwc22Q8C5N3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cwc22Q8C5N3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cwc22Q8C5N3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cwc22Q8C5N3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cwc22Q8C5N3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Cwc22Q8C5N3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cwc22Q8C5N3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Cwc22Q8C5N3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cwc22Q8C5N3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cwc22Q8C5N3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cwc22Q8C5N3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cwc22Q8C5N3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cwc22Q8C5N3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cwc22Q8C5N3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cwc22Q8C5N3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cwc22Q8C5N3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cwc22Q8C5N3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cwc22Q8C5N3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cwc22Q8C5N3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cwc22Q8C5N3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cwc22Q8C5N3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Cwc22Q8C5N3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cwc22Q8C5N3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cwc22Q8C5N3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cwc22Q8C5N3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cwc22Q8C5N3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cwc22Q8C5N3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cwc22Q8C5N3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms