Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nek11Q8C0Q4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nek11Q8C0Q4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nek11Q8C0Q4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nek11Q8C0Q4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nek11Q8C0Q4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nek11Q8C0Q4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nek11Q8C0Q4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nek11Q8C0Q4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nek11Q8C0Q4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nek11Q8C0Q4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Nek11Q8C0Q4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nek11Q8C0Q4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nek11Q8C0Q4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nek11Q8C0Q4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nek11Q8C0Q4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nek11Q8C0Q4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Nek11Q8C0Q4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nek11Q8C0Q4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Nek11Q8C0Q4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nek11Q8C0Q4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nek11Q8C0Q4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nek11Q8C0Q4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nek11Q8C0Q4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nek11Q8C0Q4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nek11Q8C0Q4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nek11Q8C0Q4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nek11Q8C0Q4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nek11Q8C0Q4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Nek11Q8C0Q4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nek11Q8C0Q4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nek11Q8C0Q4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nek11Q8C0Q4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nek11Q8C0Q4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nek11Q8C0Q4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nek11Q8C0Q4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nek11Q8C0Q4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nek11Q8C0Q4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nek11Q8C0Q4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nek11Q8C0Q4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nek11Q8C0Q4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nek11Q8C0Q4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nek11Q8C0Q4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nek11Q8C0Q4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nek11Q8C0Q4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nek11Q8C0Q4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nek11Q8C0Q4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nek11Q8C0Q4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nek11Q8C0Q4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nek11Q8C0Q4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nek11Q8C0Q4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nek11Q8C0Q4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nek11Q8C0Q4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nek11Q8C0Q4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nek11Q8C0Q4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Nek11Q8C0Q4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Nek11Q8C0Q4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nek11Q8C0Q4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nek11Q8C0Q4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Nek11Q8C0Q4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nek11Q8C0Q4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nek11Q8C0Q4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Nek11Q8C0Q4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nek11Q8C0Q4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nek11Q8C0Q4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nek11Q8C0Q4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nek11Q8C0Q4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nek11Q8C0Q4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nek11Q8C0Q4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nek11Q8C0Q4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nek11Q8C0Q4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nek11Q8C0Q4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nek11Q8C0Q4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nek11Q8C0Q4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nek11Q8C0Q4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nek11Q8C0Q4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nek11Q8C0Q4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nek11Q8C0Q4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nek11Q8C0Q4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nek11Q8C0Q4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nek11Q8C0Q4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nek11Q8C0Q4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nek11Q8C0Q4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nek11Q8C0Q4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nek11Q8C0Q4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Nek11Q8C0Q4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nek11Q8C0Q4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nek11Q8C0Q4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nek11Q8C0Q4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nek11Q8C0Q4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nek11Q8C0Q4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nek11Q8C0Q4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nek11Q8C0Q4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nek11Q8C0Q4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nek11Q8C0Q4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nek11Q8C0Q4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nek11Q8C0Q4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nek11Q8C0Q4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nek11Q8C0Q4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nek11Q8C0Q4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
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