Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg4dQ8BGV9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg4dQ8BGV9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg4dQ8BGV9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg4dQ8BGV9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg4dQ8BGV9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg4dQ8BGV9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg4dQ8BGV9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg4dQ8BGV9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg4dQ8BGV9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg4dQ8BGV9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg4dQ8BGV9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg4dQ8BGV9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg4dQ8BGV9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg4dQ8BGV9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg4dQ8BGV9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg4dQ8BGV9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg4dQ8BGV9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg4dQ8BGV9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg4dQ8BGV9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg4dQ8BGV9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg4dQ8BGV9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg4dQ8BGV9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg4dQ8BGV9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg4dQ8BGV9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg4dQ8BGV9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg4dQ8BGV9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg4dQ8BGV9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg4dQ8BGV9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg4dQ8BGV9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg4dQ8BGV9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg4dQ8BGV9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg4dQ8BGV9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg4dQ8BGV9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg4dQ8BGV9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg4dQ8BGV9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg4dQ8BGV9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg4dQ8BGV9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg4dQ8BGV9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg4dQ8BGV9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg4dQ8BGV9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg4dQ8BGV9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg4dQ8BGV9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg4dQ8BGV9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg4dQ8BGV9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg4dQ8BGV9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg4dQ8BGV9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg4dQ8BGV9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg4dQ8BGV9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg4dQ8BGV9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg4dQ8BGV9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg4dQ8BGV9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg4dQ8BGV9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg4dQ8BGV9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg4dQ8BGV9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg4dQ8BGV9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg4dQ8BGV9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg4dQ8BGV9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg4dQ8BGV9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Atg4dQ8BGV9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Atg4dQ8BGV9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Atg4dQ8BGV9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg4dQ8BGV9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg4dQ8BGV9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg4dQ8BGV9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg4dQ8BGV9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg4dQ8BGV9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg4dQ8BGV9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg4dQ8BGV9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg4dQ8BGV9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg4dQ8BGV9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg4dQ8BGV9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg4dQ8BGV9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg4dQ8BGV9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg4dQ8BGV9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg4dQ8BGV9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg4dQ8BGV9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg4dQ8BGV9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg4dQ8BGV9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg4dQ8BGV9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg4dQ8BGV9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg4dQ8BGV9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg4dQ8BGV9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg4dQ8BGV9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg4dQ8BGV9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg4dQ8BGV9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg4dQ8BGV9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg4dQ8BGV9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg4dQ8BGV9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg4dQ8BGV9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg4dQ8BGV9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg4dQ8BGV9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg4dQ8BGV9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg4dQ8BGV9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg4dQ8BGV9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg4dQ8BGV9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg4dQ8BGV9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg4dQ8BGV9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg4dQ8BGV9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg4dQ8BGV9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms