Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU5

Ccdc181, Coiled-coil domain-containing protein 181, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc181Q80ZU5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc181Q80ZU5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc181Q80ZU5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc181Q80ZU5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc181Q80ZU5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc181Q80ZU5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc181Q80ZU5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc181Q80ZU5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc181Q80ZU5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc181Q80ZU5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc181Q80ZU5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc181Q80ZU5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc181Q80ZU5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc181Q80ZU5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc181Q80ZU5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc181Q80ZU5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc181Q80ZU5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc181Q80ZU5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc181Q80ZU5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc181Q80ZU5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc181Q80ZU5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc181Q80ZU5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc181Q80ZU5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc181Q80ZU5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc181Q80ZU5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc181Q80ZU5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc181Q80ZU5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc181Q80ZU5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms