Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HhipQ7TN16 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
HhipQ7TN16 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HhipQ7TN16 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HhipQ7TN16 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HhipQ7TN16 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HhipQ7TN16 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HhipQ7TN16 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HhipQ7TN16 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HhipQ7TN16 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HhipQ7TN16 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HhipQ7TN16 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HhipQ7TN16 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HhipQ7TN16 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HhipQ7TN16 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HhipQ7TN16 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HhipQ7TN16 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HhipQ7TN16 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HhipQ7TN16 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HhipQ7TN16 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HhipQ7TN16 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HhipQ7TN16 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HhipQ7TN16 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HhipQ7TN16 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HhipQ7TN16 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HhipQ7TN16 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HhipQ7TN16 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HhipQ7TN16 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HhipQ7TN16 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HhipQ7TN16 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HhipQ7TN16 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HhipQ7TN16 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HhipQ7TN16 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HhipQ7TN16 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HhipQ7TN16 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HhipQ7TN16 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HhipQ7TN16 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HhipQ7TN16 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HhipQ7TN16 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HhipQ7TN16 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HhipQ7TN16 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HhipQ7TN16 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HhipQ7TN16 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HhipQ7TN16 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HhipQ7TN16 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HhipQ7TN16 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HhipQ7TN16 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HhipQ7TN16 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HhipQ7TN16 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HhipQ7TN16 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HhipQ7TN16 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HhipQ7TN16 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HhipQ7TN16 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HhipQ7TN16 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HhipQ7TN16 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HhipQ7TN16 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HhipQ7TN16 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HhipQ7TN16 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HhipQ7TN16 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HhipQ7TN16 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HhipQ7TN16 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HhipQ7TN16 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HhipQ7TN16 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HhipQ7TN16 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HhipQ7TN16 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HhipQ7TN16 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HhipQ7TN16 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms