Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SynmQ70IV5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SynmQ70IV5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SynmQ70IV5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SynmQ70IV5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SynmQ70IV5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SynmQ70IV5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SynmQ70IV5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SynmQ70IV5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SynmQ70IV5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SynmQ70IV5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SynmQ70IV5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SynmQ70IV5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SynmQ70IV5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SynmQ70IV5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SynmQ70IV5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SynmQ70IV5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SynmQ70IV5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SynmQ70IV5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SynmQ70IV5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SynmQ70IV5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
SynmQ70IV5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SynmQ70IV5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SynmQ70IV5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SynmQ70IV5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SynmQ70IV5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SynmQ70IV5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SynmQ70IV5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SynmQ70IV5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SynmQ70IV5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SynmQ70IV5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SynmQ70IV5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SynmQ70IV5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
SynmQ70IV5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SynmQ70IV5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SynmQ70IV5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SynmQ70IV5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SynmQ70IV5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SynmQ70IV5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SynmQ70IV5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SynmQ70IV5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SynmQ70IV5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SynmQ70IV5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
SynmQ70IV5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SynmQ70IV5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SynmQ70IV5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SynmQ70IV5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SynmQ70IV5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SynmQ70IV5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SynmQ70IV5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.77
SynmQ70IV5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SynmQ70IV5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SynmQ70IV5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SynmQ70IV5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SynmQ70IV5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SynmQ70IV5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SynmQ70IV5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
SynmQ70IV5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SynmQ70IV5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SynmQ70IV5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SynmQ70IV5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SynmQ70IV5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
SynmQ70IV5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SynmQ70IV5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SynmQ70IV5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SynmQ70IV5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SynmQ70IV5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SynmQ70IV5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SynmQ70IV5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SynmQ70IV5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SynmQ70IV5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SynmQ70IV5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SynmQ70IV5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SynmQ70IV5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
SynmQ70IV5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SynmQ70IV5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SynmQ70IV5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SynmQ70IV5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SynmQ70IV5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SynmQ70IV5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SynmQ70IV5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SynmQ70IV5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
SynmQ70IV5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SynmQ70IV5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SynmQ70IV5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
SynmQ70IV5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SynmQ70IV5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SynmQ70IV5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SynmQ70IV5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
SynmQ70IV5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SynmQ70IV5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SynmQ70IV5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SynmQ70IV5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SynmQ70IV5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SynmQ70IV5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SynmQ70IV5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SynmQ70IV5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SynmQ70IV5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SynmQ70IV5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SynmQ70IV5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms