Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnot1Q6ZQ08 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnot1Q6ZQ08 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnot1Q6ZQ08 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnot1Q6ZQ08 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnot1Q6ZQ08 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnot1Q6ZQ08 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnot1Q6ZQ08 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnot1Q6ZQ08 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnot1Q6ZQ08 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnot1Q6ZQ08 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnot1Q6ZQ08 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnot1Q6ZQ08 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnot1Q6ZQ08 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnot1Q6ZQ08 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnot1Q6ZQ08 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnot1Q6ZQ08 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnot1Q6ZQ08 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnot1Q6ZQ08 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnot1Q6ZQ08 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnot1Q6ZQ08 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cnot1Q6ZQ08 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnot1Q6ZQ08 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnot1Q6ZQ08 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnot1Q6ZQ08 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnot1Q6ZQ08 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnot1Q6ZQ08 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnot1Q6ZQ08 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnot1Q6ZQ08 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnot1Q6ZQ08 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnot1Q6ZQ08 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnot1Q6ZQ08 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnot1Q6ZQ08 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnot1Q6ZQ08 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cnot1Q6ZQ08 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnot1Q6ZQ08 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnot1Q6ZQ08 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnot1Q6ZQ08 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnot1Q6ZQ08 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnot1Q6ZQ08 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cnot1Q6ZQ08 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cnot1Q6ZQ08 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.7 ms