Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ptx4Q6RUU0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ptx4Q6RUU0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ptx4Q6RUU0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ptx4Q6RUU0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ptx4Q6RUU0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ptx4Q6RUU0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ptx4Q6RUU0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ptx4Q6RUU0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ptx4Q6RUU0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ptx4Q6RUU0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ptx4Q6RUU0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ptx4Q6RUU0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ptx4Q6RUU0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ptx4Q6RUU0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ptx4Q6RUU0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ptx4Q6RUU0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ptx4Q6RUU0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ptx4Q6RUU0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ptx4Q6RUU0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ptx4Q6RUU0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ptx4Q6RUU0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ptx4Q6RUU0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ptx4Q6RUU0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ptx4Q6RUU0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ptx4Q6RUU0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ptx4Q6RUU0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ptx4Q6RUU0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ptx4Q6RUU0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ptx4Q6RUU0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ptx4Q6RUU0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ptx4Q6RUU0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ptx4Q6RUU0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ptx4Q6RUU0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ptx4Q6RUU0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ptx4Q6RUU0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ptx4Q6RUU0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms