Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN3

Ttbk1, Tau-tubulin kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttbk1Q6PCN3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Ttbk1Q6PCN3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Ttbk1Q6PCN3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Ttbk1Q6PCN3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Ttbk1Q6PCN3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
Ttbk1Q6PCN3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Ttbk1Q6PCN3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ttbk1Q6PCN3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ttbk1Q6PCN3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ttbk1Q6PCN3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ttbk1Q6PCN3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ttbk1Q6PCN3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
Ttbk1Q6PCN3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Ttbk1Q6PCN3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Ttbk1Q6PCN3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Ttbk1Q6PCN3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Ttbk1Q6PCN3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Ttbk1Q6PCN3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ttbk1Q6PCN3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ttbk1Q6PCN3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ttbk1Q6PCN3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
Ttbk1Q6PCN3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ttbk1Q6PCN3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ttbk1Q6PCN3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ttbk1Q6PCN3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ttbk1Q6PCN3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ttbk1Q6PCN3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ttbk1Q6PCN3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ttbk1Q6PCN3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ttbk1Q6PCN3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ttbk1Q6PCN3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ttbk1Q6PCN3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
Ttbk1Q6PCN3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
Ttbk1Q6PCN3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Ttbk1Q6PCN3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Ttbk1Q6PCN3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
Ttbk1Q6PCN3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
Ttbk1Q6PCN3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Ttbk1Q6PCN3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Ttbk1Q6PCN3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Ttbk1Q6PCN3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ttbk1Q6PCN3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ttbk1Q6PCN3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ttbk1Q6PCN3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ttbk1Q6PCN3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Ttbk1Q6PCN3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ttbk1Q6PCN3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ttbk1Q6PCN3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ttbk1Q6PCN3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ttbk1Q6PCN3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Ttbk1Q6PCN3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Ttbk1Q6PCN3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Ttbk1Q6PCN3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Ttbk1Q6PCN3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Ttbk1Q6PCN3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Ttbk1Q6PCN3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Ttbk1Q6PCN3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Ttbk1Q6PCN3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Ttbk1Q6PCN3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Ttbk1Q6PCN3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
Ttbk1Q6PCN3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ttbk1Q6PCN3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ttbk1Q6PCN3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ttbk1Q6PCN3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Ttbk1Q6PCN3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Ttbk1Q6PCN3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Ttbk1Q6PCN3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Ttbk1Q6PCN3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
Ttbk1Q6PCN3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
Ttbk1Q6PCN3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Ttbk1Q6PCN3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.62
Ttbk1Q6PCN3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ttbk1Q6PCN3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ttbk1Q6PCN3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ttbk1Q6PCN3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ttbk1Q6PCN3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ttbk1Q6PCN3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ttbk1Q6PCN3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ttbk1Q6PCN3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ttbk1Q6PCN3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Ttbk1Q6PCN3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ttbk1Q6PCN3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ttbk1Q6PCN3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ttbk1Q6PCN3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ttbk1Q6PCN3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ttbk1Q6PCN3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ttbk1Q6PCN3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ttbk1Q6PCN3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ttbk1Q6PCN3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ttbk1Q6PCN3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ttbk1Q6PCN3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ttbk1Q6PCN3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ttbk1Q6PCN3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ttbk1Q6PCN3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ttbk1Q6PCN3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
Ttbk1Q6PCN3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Ttbk1Q6PCN3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Ttbk1Q6PCN3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ttbk1Q6PCN3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ttbk1Q6PCN3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
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