Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Smchd1Q6P5D8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smchd1Q6P5D8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smchd1Q6P5D8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smchd1Q6P5D8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smchd1Q6P5D8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smchd1Q6P5D8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smchd1Q6P5D8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smchd1Q6P5D8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smchd1Q6P5D8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smchd1Q6P5D8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smchd1Q6P5D8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smchd1Q6P5D8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smchd1Q6P5D8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smchd1Q6P5D8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smchd1Q6P5D8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smchd1Q6P5D8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Smchd1Q6P5D8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smchd1Q6P5D8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smchd1Q6P5D8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smchd1Q6P5D8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smchd1Q6P5D8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smchd1Q6P5D8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smchd1Q6P5D8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smchd1Q6P5D8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smchd1Q6P5D8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smchd1Q6P5D8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smchd1Q6P5D8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smchd1Q6P5D8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smchd1Q6P5D8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smchd1Q6P5D8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smchd1Q6P5D8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smchd1Q6P5D8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Smchd1Q6P5D8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smchd1Q6P5D8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Smchd1Q6P5D8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smchd1Q6P5D8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smchd1Q6P5D8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smchd1Q6P5D8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smchd1Q6P5D8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Smchd1Q6P5D8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smchd1Q6P5D8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smchd1Q6P5D8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smchd1Q6P5D8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smchd1Q6P5D8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smchd1Q6P5D8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smchd1Q6P5D8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smchd1Q6P5D8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smchd1Q6P5D8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Smchd1Q6P5D8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Smchd1Q6P5D8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smchd1Q6P5D8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smchd1Q6P5D8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smchd1Q6P5D8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smchd1Q6P5D8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smchd1Q6P5D8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smchd1Q6P5D8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smchd1Q6P5D8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smchd1Q6P5D8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Smchd1Q6P5D8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smchd1Q6P5D8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smchd1Q6P5D8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Smchd1Q6P5D8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smchd1Q6P5D8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smchd1Q6P5D8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smchd1Q6P5D8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smchd1Q6P5D8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smchd1Q6P5D8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smchd1Q6P5D8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smchd1Q6P5D8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smchd1Q6P5D8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smchd1Q6P5D8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smchd1Q6P5D8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms