Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV83

U2surp, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2surpQ6NV83 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
U2surpQ6NV83 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
U2surpQ6NV83 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
U2surpQ6NV83 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
U2surpQ6NV83 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
U2surpQ6NV83 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
U2surpQ6NV83 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
U2surpQ6NV83 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
U2surpQ6NV83 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
U2surpQ6NV83 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
U2surpQ6NV83 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
U2surpQ6NV83 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
U2surpQ6NV83 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
U2surpQ6NV83 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
U2surpQ6NV83 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
U2surpQ6NV83 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
U2surpQ6NV83 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
U2surpQ6NV83 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
U2surpQ6NV83 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
U2surpQ6NV83 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
U2surpQ6NV83 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
U2surpQ6NV83 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
U2surpQ6NV83 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
U2surpQ6NV83 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
U2surpQ6NV83 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
U2surpQ6NV83 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
U2surpQ6NV83 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
U2surpQ6NV83 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
U2surpQ6NV83 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
U2surpQ6NV83 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
U2surpQ6NV83 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
U2surpQ6NV83 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
U2surpQ6NV83 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
U2surpQ6NV83 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
U2surpQ6NV83 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
U2surpQ6NV83 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
U2surpQ6NV83 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
U2surpQ6NV83 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
U2surpQ6NV83 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
U2surpQ6NV83 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
U2surpQ6NV83 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
U2surpQ6NV83 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
U2surpQ6NV83 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
U2surpQ6NV83 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
U2surpQ6NV83 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26■■□□□ 1.75
U2surpQ6NV83 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
U2surpQ6NV83 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
U2surpQ6NV83 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
U2surpQ6NV83 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
U2surpQ6NV83 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
U2surpQ6NV83 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
U2surpQ6NV83 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
U2surpQ6NV83 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
U2surpQ6NV83 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
U2surpQ6NV83 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
U2surpQ6NV83 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
U2surpQ6NV83 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
U2surpQ6NV83 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
U2surpQ6NV83 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
U2surpQ6NV83 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
U2surpQ6NV83 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
U2surpQ6NV83 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
U2surpQ6NV83 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
U2surpQ6NV83 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
U2surpQ6NV83 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
U2surpQ6NV83 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
U2surpQ6NV83 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
U2surpQ6NV83 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
U2surpQ6NV83 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
U2surpQ6NV83 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
U2surpQ6NV83 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
U2surpQ6NV83 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
U2surpQ6NV83 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
U2surpQ6NV83 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
U2surpQ6NV83 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
U2surpQ6NV83 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
U2surpQ6NV83 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
U2surpQ6NV83 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
U2surpQ6NV83 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
U2surpQ6NV83 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
U2surpQ6NV83 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
U2surpQ6NV83 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
U2surpQ6NV83 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
U2surpQ6NV83 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
U2surpQ6NV83 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
U2surpQ6NV83 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
U2surpQ6NV83 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
U2surpQ6NV83 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
U2surpQ6NV83 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
U2surpQ6NV83 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
U2surpQ6NV83 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
U2surpQ6NV83 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
U2surpQ6NV83 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
U2surpQ6NV83 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
U2surpQ6NV83 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
U2surpQ6NV83 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
U2surpQ6NV83 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
U2surpQ6NV83 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
U2surpQ6NV83 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
U2surpQ6NV83 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 230.2 ms